唐-尼爾森執(zhí)教獨行俠時期在季后賽失利后，選擇辭掉所有職務(wù)退隱江湖。過了一個賽季，2006年夏天，突如其來的邀約，唐-尼爾森再次出山。當(dāng)時尼爾森是收到弟子穆林（當(dāng)時勇士隊經(jīng)理）的邀約，出任勇士隊的主教練一職。唐-尼爾森那股熱情再次燃起，接手勇士隊開發(fā)“勇士田徑隊2.0”。

想要平息教練界科學(xué)家那股研究的熱情，實在太難了。06-07賽季的勇士不再是當(dāng)年TMC組合（穆雷、哈達(dá)威和里奇蒙德）的勇士，但是也阻止不了尼爾森跑轟戰(zhàn)術(shù)的理念。他決定按照TMC組合的模板，尋找新的成員。當(dāng)時勇士的陣容正有這些風(fēng)格的球員，“大胡子”拜倫-戴維斯就是蒂姆-哈達(dá)威，理查德森就是里奇蒙德，接著通過交易得到斯蒂芬-杰克遜，他就是穆林。第二陣容有著埃利斯、邁克-鄧?yán)S、哈靈頓、巴恩斯等角色球員，都是快攻高手。就這樣，尼爾森教練成功組合了“勇士田徑隊2.0”。

誰也沒想到，這套陣容打出當(dāng)年TMC組合的風(fēng)格，06-07賽季，勇士場均得分達(dá)到106.5分，排在聯(lián)盟第二，場均失分106.9分，排在聯(lián)盟倒數(shù)第30。場均回合數(shù)高達(dá)99次，憑借這套陣容，勇士以42勝40負(fù)的戰(zhàn)績，排在西部第8，闖進(jìn)季后賽面對尼爾森老當(dāng)家獨行俠。當(dāng)年的獨行俠由諾維茨基帶隊，他們以67勝15負(fù)的戰(zhàn)績，西部第一的身份進(jìn)入季后賽。雙方的實力差距真的很大，但是誰也沒想到，這是一個個誕生神跡的系列賽。

面對實力雄厚的獨行俠，尼爾森一點都不慌，腦海仿佛已經(jīng)制定好策略戰(zhàn)勝獨行俠。尼爾森對獨行俠的球員和戰(zhàn)術(shù)非常熟悉，畢竟執(zhí)教多個賽季，而諾維茨基也是他一手帶出來的。尼爾森利用勇士的跑轟打破獨行俠全隊的進(jìn)攻節(jié)奏，讓對手跟著他們跑起來，完全陷入快速轉(zhuǎn)換的節(jié)奏中。讓陣地戰(zhàn)的獨行俠實在難受，像諾維茨基這種類型的大個子，不停折返跑會消耗過多的體力。

最終勇士創(chuàng)造黑八神跡，大比分以4-2戰(zhàn)勝獨行俠，尼爾森的改造再次成功，并且?guī)砬蜿爲(wèi)?zhàn)勝常規(guī)賽第一名的獨行俠。諾維茨基被尼爾森教練安排得明明白白，比賽結(jié)束后黯然失色回到更衣室。利用快打旋風(fēng)，讓對方陷入自己的節(jié)奏中，不停增加回合次數(shù)，得到不錯的效果。發(fā)動機“大胡子”戴維斯完美充當(dāng)領(lǐng)袖的角色，那輪系列賽中場均達(dá)到25分，不僅進(jìn)攻發(fā)揮出色，在組織端場均送出5.6次助攻，把跑轟戰(zhàn)術(shù)發(fā)揮到極致。

2007-08賽季，勇士隊雖然取得48勝34負(fù)的戰(zhàn)績，但是那個賽季競爭非常激烈，最終以這個戰(zhàn)績無緣季后賽。隨后勇士逐漸衰退，并沒有把狀態(tài)保持下去。2008-09賽季的戰(zhàn)績?yōu)?9勝53負(fù)，2009-10賽季的戰(zhàn)績?yōu)?6勝56負(fù)，勇士的表現(xiàn)一落千丈。到了2010年9月，勇士隊正式解雇唐-尼爾森，由球隊助理教練基斯-斯馬特頂替。離開勇士后，尼爾森再也沒有上崗教練的職位，直到2012年八月份，唐-尼爾森正式宣布結(jié)束執(zhí)教生涯。“瘋狂科學(xué)家”終于放下那股研究的沖勁，退隱江湖。

尼爾森在教練31年執(zhí)教生涯中，總執(zhí)教場數(shù)2398場，勝場1335場，是NBA歷史上取得勝場最多的主教練  。在2012年9月份，唐-尼爾森正式入選籃球名人堂。不愧是教練界的科學(xué)家，31年的執(zhí)教生涯中，留下眾多的“試驗品”，為往后的籃球戰(zhàn)術(shù)奠定堅固的基礎(chǔ)。像波波維奇、萊利等等名帥都是非常敬佩老尼爾森，不管如何，他的一生都是偉大的。